提高裝卸作業(yè)效率。由于集裝箱的裝卸作業(yè)適于機(jī)械化，其裝卸作業(yè)效率得到了大幅度的提高。同時(shí)，大大縮短了集裝箱的站（港）的停留時(shí)間，加速了車(chē)船的周轉(zhuǎn)和貨物的送達(dá)。

集裝箱運(yùn)輸?shù)墓芾矸椒ê凸ぷ黧w系與傳統(tǒng)運(yùn)輸方式不同，其主要的關(guān)系方有集裝箱運(yùn)輸經(jīng)營(yíng)人、無(wú)船承運(yùn)人(NVOCC)、實(shí)際承運(yùn)人、集裝箱租賃公司、集裝箱碼頭（堆場(chǎng)）和貨運(yùn)站。

減少貨損貨差，提高貨運(yùn)質(zhì)量。由于集裝箱是一個(gè)堅(jiān)固密封的箱體，集裝箱本身就是一個(gè)堅(jiān)固的包裝。貨物裝箱并鉛封后，途中無(wú)須拆箱倒載，一票到底，即使經(jīng)過(guò)長(zhǎng)途運(yùn)輸或多次換裝，不易損壞箱內(nèi)貨物。集裝箱運(yùn)輸可減少被盜、潮濕、污損等引起的貨損和貨差，并且由于貨損貨差率的降低，減少了社會(huì)財(cái)富的浪費(fèi)，也具有很大的社會(huì)效益。

船公司對(duì)船舶和集裝箱進(jìn)行巨額投資。根據(jù)有關(guān)資料表明，集裝箱船每立方英尺的造價(jià)約為普通貨船的3.7~4倍。集裝箱的投資相當(dāng)大，開(kāi)展集裝箱運(yùn)輸所需的高額投資，使得船公司的總成本中固定成本占有相當(dāng)大的比例，高達(dá)三分之二以上。

集裝箱運(yùn)輸涉及面廣、環(huán)節(jié)多、影響大，是一個(gè)復(fù)雜的運(yùn)輸系統(tǒng)工程。集裝箱運(yùn)輸系統(tǒng)包括海運(yùn)、陸運(yùn)、空運(yùn)、港口、貨運(yùn)站以及與集裝箱運(yùn)輸有關(guān)的海關(guān)、商檢、船舶代理公司、貨運(yùn)代理公司等單位和部門(mén)。如果互相配合不當(dāng)，就會(huì)影響整個(gè)運(yùn)輸系統(tǒng)功能的發(fā)揮，如果某一環(huán)節(jié)失誤，必將影響全局，甚至導(dǎo)致運(yùn)輸生產(chǎn)停頓和中斷。因此，要求搞好整個(gè)運(yùn)輸系統(tǒng)各環(huán)節(jié)、各部門(mén)之間的高度協(xié)作。

由于集裝箱運(yùn)輸在不同運(yùn)輸方式之間換裝時(shí)，勿需搬運(yùn)箱內(nèi)貨物而只需換裝集裝箱，這就提高了換裝作業(yè)效率，適于不同運(yùn)輸方式之間的聯(lián)合運(yùn)輸。在換裝轉(zhuǎn)運(yùn)時(shí)，海關(guān)及有關(guān)監(jiān)管單位只需加封或驗(yàn)封轉(zhuǎn)關(guān)放行，從而提高了運(yùn)輸效率。