目前，化肥被大量施用以保持農林業(yè)高產。但是，隨著化肥用量不斷增加，土壤開始板結，化肥淋入地下水也將造成水污染。近年來，我國提倡有機農業(yè)，大量應用有機肥，達到保持作物產量的同時，保護土地和環(huán)境。畜禽糞便是有機肥重要來源，2016年我國僅養(yǎng)殖肉牛產生的牛糞就達到15萬噸以上，為我國有機肥生產提供了充足的原料。另外，我國小麥歷年種植面積為我耕種地總面積的22％～30％，產生大量小麥秸稈，秸稈為養(yǎng)殖業(yè)提供飼料，也為有機肥生產提供了豐富原料。但是，豐富的原料只是生產的基礎，重要的是對這些原料的加工利用。其中關鍵的是有機肥原料的發(fā)酵腐熟技術不斷發(fā)展與創(chuàng)新。

微生物代謝物有直接殺菌的作用且進入土壤會在根際定殖，搶占生態(tài)位點讓線蟲及真無法侵染。有益微生物進入土壤會在根系周圍產生大量粘多糖與植物分泌的粘液及礦物膠體、有機交替相結合，形成土壤團粒結構，提高土壤蓄肥、保水能

生物菌肥是一種使用微生物菌群作為主要成分的有機肥料。它通過添加益生菌和有益微生物來改善土壤質量和植物生長環(huán)境。 生物菌肥中的微生物菌群包括一些對植物生長有促進作用的細菌和真菌，例如固氮菌、磷解菌和有機物分解菌等。這些微生物能夠與植物根系共生，提供植物所需的養(yǎng)分，促進植物的生長和發(fā)育。