通過有益微生物和蚯蚓的生命活動，產生了生長素、細胞分裂素、赤霉素、吲哚酸等植物激素，促進植物生長，調控植物代謝；還會產生大量多糖。其中的有益微生物還能產生拮抗活性強、抗菌譜廣的抗生素，限制病原菌的生長，使植物土傳病害得到抑制。

由于蚯蚓糞中含有高達45%以上有機物和無機營養(yǎng)物以及植物生長激素，與其他肥料相比，具有衛(wèi)生、無異味、顆粒細小均勻，吸水保水、透氣等性能還富含有益微生物，這些都是其他合成肥料所不具備的，因此可作為園林花卉、溫室大棚種植的有機肥。 它所含的吲哚乙酸、赤霉素等激素能促進植物生長；所含黃腐酸對植物（如花椒、番茄）生長量、葉面積等亦有明顯促進作用。

蚯蚓糞中還富含各種微生物，微生物不僅可以使復雜的物質礦化為易于植物吸收的有效營養(yǎng)成分，還能合成一系列有生物活性的物質，如糖、氨基酸、維生素等，這是蚯蚓糞所特有的性質。正是因為蚯蚓糞含有大量的營養(yǎng)物質，和微生物菌群，對植物生長有著神奇的效果，才被譽為“有機肥”。