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轉(zhuǎn)錄因子ChIP-seq整體服務(wù)
發(fā)布時(shí)間:2017-09-13 09:40:24 | 瀏覽次數(shù)：



項(xiàng)目簡(jiǎn)介

基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控是生物基因表達(dá)調(diào)控層次中關(guān)鍵的一層，而轉(zhuǎn)錄因子是參與基因表達(dá)調(diào)控的一類重要的細(xì)胞核蛋白質(zhì)。轉(zhuǎn)錄因子通過(guò)特異性結(jié)合調(diào)控區(qū)域的DNA序列來(lái)調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄過(guò)程，因此在全基因組水平將轉(zhuǎn)錄因子定位于靶基因DNA是認(rèn)識(shí)轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的有效方法之一。
通過(guò)轉(zhuǎn)錄因子ChIP-Seq技術(shù)能夠揭示轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合位點(diǎn)和確定直接的靶基因序列，可在體內(nèi)分析特定啟動(dòng)子的分子調(diào)控機(jī)制。ChIP-Seq已廣泛應(yīng)用于研究一些經(jīng)典轉(zhuǎn)錄因子和一些新的轉(zhuǎn)錄因子在全基因組上的結(jié)合情況，實(shí)現(xiàn)全基因組層面分析一些經(jīng)典的轉(zhuǎn)錄因子的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，或?yàn)樾罗D(zhuǎn)錄因子的功能研究提供一些線索。
表觀生物技術(shù)團(tuán)隊(duì)具備豐富的ChIP實(shí)驗(yàn)經(jīng)驗(yàn)，利用經(jīng)驗(yàn)證的ChIP級(jí)抗體，提供轉(zhuǎn)錄因子共沉淀服務(wù)，并結(jié)合新一代高通量測(cè)序技術(shù)，為生物醫(yī)學(xué)研究人員提供轉(zhuǎn)錄因子研究整體服務(wù)（ChIP-seq）。



項(xiàng)目流程 ：


樣本要求：
人及大鼠或小鼠細(xì)胞
細(xì)胞量達(dá)到107個(gè)
組織樣本需評(píng)估

測(cè)序模式：
SE50

測(cè)序數(shù)據(jù)量：
20M

生物信息分析內(nèi)容

一、標(biāo)準(zhǔn)信息分析
1. 去接頭污染，去低質(zhì)量reads和測(cè)序質(zhì)量評(píng)估
2. ChIP測(cè)序序列與參考基因組序列的比對(duì)
3. ChIP測(cè)序reads在全基因組的分布
4. Peak鑒定及基因原件分析
5. Peak相關(guān)基因篩選與GO功能聚類分析、Pathway分析

二、信息分析
可根據(jù)客戶的需求，定制信息分析內(nèi)容。

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